Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLDN9O95484 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLDN9O95484 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLDN9O95484 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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CLDN9O95484 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN9O95484 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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