Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMED7Q9Y3B3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms