Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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