Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms