Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHP1Q99653 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms