Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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