Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms