Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms