Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMBRD2Q68DH5 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms