Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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