Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ARMC8-201ENST00000358441 3181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC01119-202ENST00000468141 2157 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AL031846.2-201ENST00000624656 3671 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC00319-202ENST00000448049 3507 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CD300CQ08708 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms