Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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