Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNA1P20827 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms