Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms