Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP35Q9P2H5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms