Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms