Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM139Q8IV31 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms