Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRAPPC6BQ86SZ2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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