Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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SIX1Q15475 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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SIX1Q15475 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SIX1Q15475 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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