Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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