Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 IGSF5-201ENST00000380588 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC107892.1-201ENST00000577382 2727 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 PSMD10-201ENST00000217958 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 EIF2A-214ENST00000487799 1913 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TCTE1-202ENST00000371505 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 THRAP3P1-201ENST00000411753 2786 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 UNC45B-203ENST00000591048 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 NPAP1P6-201ENST00000440671 3484 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KIRREL3-201ENST00000525144 3808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms