Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms