Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms