Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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