Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCL8P80075 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CCL8P80075 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms