Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 SLC6A2-203ENST00000414754 3201 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NOD2-201ENST00000300589 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AMER3-201ENST00000321420 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PIK3R4-201ENST00000356763 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 FAM196A-203ENST00000614311 4335 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AC004490.1-201ENST00000585593 2738 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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TMEM258P61165 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PGM2L1-201ENST00000298198 8515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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TMEM258P61165 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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TMEM258P61165 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 AL445471.2-201ENST00000568143 2443 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 ZSCAN2-204ENST00000358472 3231 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 PLAT-204ENST00000429710 1655 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 MEP1A-202ENST00000611727 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMEM258P61165 HAUS8-203ENST00000593360 3176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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