Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ACTBP60709 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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