Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDIT3P35638 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms