Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2H1P32780 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2H1P32780 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H1P32780 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms