Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF2E1P29083 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms