Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFP17480 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBTFP17480 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBTFP17480 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBTFP17480 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBTFP17480 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBTFP17480 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBTFP17480 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBTFP17480 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms