Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms