Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms