Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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