Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P3H3Q8IVL6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P3H3Q8IVL6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms