Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms