Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms