Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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