Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms