Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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