Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms