Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms