Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFNP31947 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFNP31947 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms