Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD1CP29017 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD1CP29017 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD1CP29017 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD1CP29017 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD1CP29017 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD1CP29017 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms