Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYN1P17600 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYN1P17600 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYN1P17600 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms