Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms