Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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