Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FANCFQ9NPI8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms