Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC17Q9NP64 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms