Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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